La guerre a réduit le Japon à zéro, et Godzilla l’a plongé en dessous de zéro. Deux années se sont écoulées depuis, durant lesquelles le pays a mené un combat douloureux pour se reconstruire et retrouver enfin une vie normale. Alors que l’humanité était parvenue à préserver une paix chèrement acquise, une nouvelle menace surgit et anéantit tout espoir en un instant. Il n’y aura pas de troisième fois. Tout s’achève ici.